Polvere di omopiperazina è usato per preparare 1,4-bis- (2-tiazolyl) -1,4-diazacicloeceptano reagendo con 2-bromo-tiazolo. Funge da intermedio per repaglinide e fasudil cloridrato. Viene anche usato nella preparazione di potenti antagonisti del recettore H3, che viene utilizzato per il trattamento delle condizioni neurodegenerative. Inoltre, è utilizzato in prodotti vesicant, cosmetici, emulsionanti e energetici. Agisce come inibitore di corrosione per il ferro. Nei prodotti farmaceutici, è impiegato come antipiretico e riduce la glicemia, adiposità, calma, antipsicotico e anti-nervoso.